Genų prognozavimo ir skaičiavimo procesas
Genų prognozavimo ir skaičiavimo procesas!
Annonacija yra procesas, kuris identifikuoja genus, jų reguliavimo sekas ir galimas funkcijas. Annonacija nurodo ne baltymų koduojančius genus, r RNR, t RNR ir branduolinių RNR koduojančius genus, mobilius genetinius elementus ir kartotines sekas, esančias genome.
Anonavimo užduotis pradedama tik gavus genomo seką. Genų prognozavimas yra svarbi skaičiavimo biologijos problema ir yra įvairių logaritmų, kurie gali būti naudojami genų prognozavimui, naudojant nustatytus genus kaip mokymo duomenų rinkinį.
Genų skaičiavimas tampa sunku, nepaisant geno buvimo geno genoje buvimo. Sutampančių genų ir susiliejimo variantų buvimas tampa sudėtingesnis. Sunku nuspėti, kurios DNR dalys turėtų būti laikomos vienodomis ar įvairiomis genomis.
Pav. SNP žemėlapis
Daugelis eukariotų genų turi egzonų (koduojančių regionų) modelį, po kurio seka intronai (nekoduojantys regionai). Dėl šių genų nėra organizuojami kaip nuolatiniai ORF (atviri skaitymo rėmai). ORF yra kodonų serija, kuri nurodo aminorūgščių seką.
Antrieji eukariotų genai paprastai yra plačiai išdėstyti, todėl turi daugiau galimybių surasti netikrus genus. Tačiau nauji ORF skenavimo programinės įrangos eukariotinių genų metodai daro efektyvesnį skenavimą. Dabar galime suskaičiuoti organizmo genus (su tam tikra eksperimentine klaida).
Sakoma, kad apie 99, 8 proc. 3, 2 mlrd. Bazinių porų tarp dviejų žmonių yra vienodi ir tik 0, 2 proc. Kas 500 nukleotidų tik vienas nukleotidas skiriasi tarp dviejų asmenų. Tai reiškia, kad kai kuriose DNR sekos vietose yra skirtumų, dėl kurių gali pasireikšti sunki liga ir skirtingi žmogaus simboliai.
Genomo panašumas, SNP ir lyginamoji genomika:
Kaip jau minėta, 99, 8 proc. Kiekvieno žmogaus genomo yra panašus į bet kurį kitą žmogaus genomą ir 0, 2 proc. Tai reiškia, kad du asmenys skiriasi tik 6 mln.
Jei šių vietų poveikis yra mažas, du žmonės bus identiški. Žmonės yra daugiau kaip 98% panašūs į šimpanzes. Taigi skirtingų DNR vietų skirtumai lemia individualų unikalų. Kiekvienam 500-1000 nukleotidų vienam nukleotidui skiriasi du asmenys.
Svarbūs atskirų genomų skirtumai yra vieno nukleotido polimorfizmai arba SNP, kurie buvo pastebėti ir koduojančiuose, ir nekoduojančiuose genomo regionuose. SNP iš esmės keičia vieną bazę, ty A, C, G arba T, dėl kurių DNR variacijos atsiranda dėl skirtingų raidžių. Nukleotido arba bazės tipas, esantis tam tikroje chromosomos vietoje, gali skirtis priklausomai nuo skirtingų žmonių.
Sakoma, kad - 90% žmonių sekos variacijų atsiranda dėl SNP. Taigi SNP suteikia molekulinį žymeklį, esantį didelio tankio.
DNR pirštais spausdinant ypač nekoduojančiose genomo dalyse naudojami tokie genetiniai skirtumai tarp skirtingų žmonių.
Tokie genetiniai variantai taip pat yra atsakingi už ligos sunkumą ir kūno reakciją į gydymą. Apo E geno vienintelis bazinis skirtumas sukelia Alzheimerio ligą, o išbraukimas CCRS (chemokino receptorių genas) yra atsakingas už HW ir AIDS atsparumą.
SNP yra naudojami genų, susijusių su žmonių ligomis, žemėlapiams surinkti. Naudojant SNP kaip žymenis, kiekvienas žmogaus genomo genas gali būti užfiksuotas. SNP yra arba geno viduje, arba gali turėti glaudų ryšį.
Sekos duomenys saugomi duomenų bazėse ir analizuojami, kad būtų žinomi SNP. SNP identifikavimui sukurti buvo sukurti DNR lustai ir mikroschemos. Gydytojai, naudojantys DNR mėginius, gali nustatyti SNP genotipo profilio modelį. Taigi jie gali pasakyti pacientų reakciją į specifinį vaisto tipą.
Farmacijos filialas, kuris tiria genetinio kintamumo poveikį ligos jautrumui ir gydymui, vadinamas farmakogenomika.
Kadangi mažai SNP skirtingose populiacijose skiriasi, SNP analizė gali būti naudojama tiriant populiacijos genetiką.
Įdomu pažymėti, kad pelės ir žmogaus genomai labai panašūs vienas į kitą (apie 97, 5%). Šimpanzė ir žmogaus genomas skiriasi tik santykiu 1 - 3%. Taigi galima daryti išvadą, kad dėl bendro protėvio pasidalijimo prieš 100 milijonų metų, o genomo pokyčių nebuvo.
Iš šių mažų genetinių skirtumų kyla žmogaus įvairovė, pavyzdžiui, akių regos, plaukų spalvos, pėdų dydžio ir kt. .
